聚甲基丙烯酸酯基反相柱現有各種孔徑和粒徑可供選擇。盡管不如硅膠基質RPC柱有效和堅固，但聚合物柱也具有明顯的優點，如較廣的pH范圍（1~12），可使多種堿性化合物在未帶電形式下接受分析，因而減少第二類吸附作用并改良峰形。第二類相互作用的減少使多肽和蛋白質回收率得以提高。